据报道，结核性肛瘘约占肛瘘的4％~10％。原发的结核性肛瘘很少见，多数是有肺结核病，然后结核菌通过吞咽或血行感染肛门，导致结核性肛周脓肿，脓肿破溃或手术切开后，逐渐形成结核性肛瘘。结核性肛瘘的特点是起病缓慢，局部脓肿形成时无明显疼痛；溃破后脓汁稀薄，病程较长，缠绵不愈；瘘管内口较大，边缘不整齐，肉芽不新鲜，瘘管分支多。此类病人还常伴有全身的结核中毒症状，如低热、盗汗、乏力、消瘦等。

结核性肛瘘的治疗，首先是按正规的抗结核方案进行，如肌内注射链霉素、口服雷米封片等。就是采取了手术治疗，抗结核要也不能停。有些医生在手术后换要时在局部适当加人抗结核要是可行的。结核性肛瘘手术后很可能长时间不愈合，要有这个思想准备。其手术方法与其他肛瘘手术方法是一样的，因其具有传染性，换要工具要用一次性的。