直肠的生理功能大致有三：一是吸收功能，直肠能吸收水分和一些要物，所以一些肠道疾病和其他器官的疾病可以通过直肠给要来治疗。二是分泌功能，直肠黏膜内有杯状细胞，能分泌碱性液体来保护直肠黏膜，润滑大便以助排便。但在痔疮等慢性炎症刺激下，黏液分泌过多可从肛门渗出而刺激肛周皮肤，导致肛门疹痒。三是排粪功能，当直肠内粪便量蓄积到150毫升以上时，刺激直肠下段肠壁内的压力感受器，通过复杂的神经反射开启肛门，同时增加腹压和肠内压力，将粪便排出体外。