家族性腺瘤性息肉病是一种全身性疾病。大约35岁后大肠的息肉开始有恶性的病理变化。家族性腺瘤性息肉病患者并有较高合并其他部位恶变症的发生几率。这类患者还会并发多种大肠外病变，如小肠息肉、甲状腺恶变、胃恶变、胰腺恶变、硬纤维瘤等。因此，即使切除了全大肠，其余病变还有可能威胁患者生命，因此，FAP患者术后还应该定期复查肠镜，明确回肠储袋有无息肉，行十二指肠镜检查明确上消化道有无病变等。