肛门疼痛患者临床并不少见，大多数患者能找到明确的病因，但少部分患者病因不清，总体而言，导致肛门疼痛的原因大致有以下几个方面：

1) 精神因素：多由精神紧张引起，如肛门直肠的神经官能症、阴部神经的症候群、坐骨神经痛以及尾骨神经痛反射至肛门而引起肛门疼痛；

2) 异物及不良饮食刺激：如外伤、直肠内异物、辛辣食物及酗酒等均可刺激肛门，而引起疼痛；

3) 肛门直肠周围感染：即肛门直肠周围脓肿、肛窦炎、肛乳头炎等，这些疾病也可造成肛门疼痛；

4) 肛门疾病：如痔疮嵌顿、炎性外痔、血栓外痔、肛裂、肛瘘等，均可引起肛门疼痛；

5) 肠道感染或腹泻、便秘：肠道感染，可使炎症刺激肛门，腹泻和便秘可使粪便通过肛门时，机械性刺激肛门，从而导致肛门疼痛；

6) 肛管直肠恶化：无论良性恶化，还是恶性恶化，其表面黏膜感染或直接压迫肛门部，都可引导起肛门疼痛。晚期肛管直肠恶变侵犯神经，可导致剧烈疼痛。