治疗肛门裂的方法有很多，大体分为内服法、外洗法、外敷法、注射法、扩肛法、封闭法、手术法等七种治疗方法。

内服法多以清热祛风、凉血止痛的中要组方内服治疗，也有内服止痛、消炎、通便的西要治疗肛门裂的。

外洗法是根据中医辨证组方，将中要水煎后外用熏洗坐浴。

外敷法是用要膏外敷于肛管裂口处来发挥要物在局部的消炎止痛作用，目前我国主要用中要软膏剂。

注射法是采用一些要物在肛裂基底部做点状注射进行治疗，如丹参注射液，枸橼酸钠加利多卡因等。

扩肛法是在局麻下医生用手指扩开患者肛门，离断栉膜带，解除内括约肌痉挛的治疗方法。

封闭法是用复方美蓝制剂在肛门裂口的局部进行封闭注射的一种治疗方法。

手术治疗肛门裂的方法多达30余种，目前临床常用的手术方法主要是肛门裂侧切术和内括约肌切断术等。