一般针对慢传输型便秘(STC)患者，可采用结肠次全切除和回直肠吻合术；对出口梗阻型便秘(FOOC)患者可行肛管直肠括约肌切除术。

对于STC患者，手术的设计是用来治疗便秘症状，即使能够缓解便秘，其他症状，(比如腹胀和腹痛)可能得不到缓解；尽管理论上切断耻骨直肠肌纤维对于排便时该肌肉矛盾性收缩的FOOC患者应该有效，然而事实上该方法的效果并不令人满意，在众多慢性便秘患者中只有一小部分能从手术中受益。