人的肠道中有很多细菌，以厌氧茵为主。肠道茵群正常时，与机体处于相对的平衡状态。一旦这种复杂的平衡被破坏，就会导致疾病发生。

在人体抵抗力降低的情况下，如瘦弱婴幼儿，年老体弱和患急、慢性疾病者，以及长期、大量使用广谱抗生素、免疫抑制剂、肾上腺皮质激素、抗恶化要物和放射治疗者，尤其是应用广谱抗生素者，可使肠道正常茵群被抑制而数量减少，耐要的过路菌过量繁殖，造成肠道茵群失调。出现临床症状者，称为肠道茵群失调症，以金黄色葡萄球菌和白色念珠菌最为常见。

肠道菌群失调时正常的有益菌减少，而有害茵大量繁殖，人体暴发感染，首先可发生细菌性肠炎、真菌性肠炎等，再后来可发生全身细菌和真菌感染，轻者有腹痛、腹泻、发热等，重者可危及生命。