结肠镜能够直接地看到结肠豁膜的病变，还可以取活检（病理检查）。所谓的病理检查就是医生用特殊的小钳子从患者的肠道赫膜上取下一小块，然后通过特殊的染色在显微镜下观察肠道的赫膜细胞、组织形态与结构的检查方法，这是一种有损伤的检查，但是它对炎症、恶化等疾病的诊断是最准确的金标准。怀疑便秘的患者有炎症、恶化以及有一些肠道先天异常如先天性巨结肠等疾病时，或者常规检查做了以后仍然病因不明确时就需要做这个检查了。但是年老体衰的患者可能就承受不了。X 线检查（全消化道）只能观察食管、胃、十二指肠、小肠的病变，而气钡灌肠检查只能检查结肠及直肠的病变。相对结肠镜来说前述检查痛苦较小，年老的患者基本都能承受，如果老年患者肛门括约肌功能差的不能接受该检查。X 线检查是一种间接的观察手段，不能取活检，在肠道有出血或者炎症很重时不能进行，有经验的医生会根据不同的患者选择最合适、最经济的方法以便尽快明确诊断。

无论是全消化道钡餐检查、钡剂灌肠还是结肠镜检查，都需要清洁肠道（检查前服用泻要或灌肠）。